Das Stadtmuseum von Nepi nutzt ein modernes und faszinierendes Ausstellungssystem, das anhand der archäologischen Funde die historische Entwicklung der Stadt und ihres Territoriums von der Vorgeschichte bis zur Renaissance veranschaulicht.

Der wichtigste Teil der städtischen Sammlung, die die Museumsstruktur einzigartig unter den städtischen Museen Latiums macht, besteht aus Materialien der faliskanischen Nekropole (7. - 3. Jahrhundert v. Chr.), die die Stadt umgeben.

Unter diesen ist die "Nekropole von Sante Grotte" diejenige, die die bedeutendsten archäologischen Funde zurückgebracht hat. Einige Ausgrabungskampagnen, die zwischen 2003 und 2004 durchgeführt wurden, haben tatsächlich die außergewöhnliche Entdeckung einiger noch intakter Kammergräber und Bestattungen in der für Kinder reservierten Grube ermöglicht. In den Kammergräbern wurden reiche Grabbeigaben gefunden, die durch das Vorhandensein von in Griechenland hergestellter Keramik, Bronzegegenständen und persönlichen Ornamenten in Gold und Silber gekennzeichnet sind.

Die Faszination dieser Entdeckungen kann der Besucher durch ein Video nacherleben, das die eindrucksvollsten Phasen der Ausgrabung mit sensationellen Bildern dokumentiert.

Die Geschichte von Nepi hat aber auch andere wichtige Zeugnisse hinterlassen. Tatsächlich kann man neben den außergewöhnlichen Funden aus der faliskischen Zeit Werke wie ein Porträt des Kaisers Augustus und ein seltenes Marmorwappen von Lucrezia Borgia bewundern.